Первоначально был построен в 1716 году, на месте, где, по преданию, в конце XVII века святитель Филофей Лещинский крестил юганских остяков. Здание за всю двухсотлетнюю историю несколько раз перестраивалось. Сохранившееся по сегодня деревянное строение возведено прихожанами в 1887 г., имело один престол в честь Богоявлении Господня. При храме находилась церковно-приходская школа, которая бесплатно размещалась в здании инородческой управы.